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Nature Methods发表论文报道5-醛基胞嘧啶测序新技术

※发布时间:2015-9-9 9:22:30   ※发布作者:A   ※出自何处: 

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  5-甲基胞嘧啶修饰(5mC)是真核细胞基因组中最为重要的表观遗传修饰之一。5mC可以在TET家族酶的作用下,逐步氧化生成5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC);后两者也可以被TDG糖基化酶所识别并切除。

  2015年9月7日,大学生命科学学院伊成器研究组在《Nature Methods》在线发表题为“Bisulfite-free, base-resolution analysis of 5-formylcytosine at the genome scale”的研究论文(DOI: 10.1038/nmeth.3569)。文章报道了一种通过化学标记和富集手段,首次实现了免亚硫酸氢盐处理(bisulfite-free)的5-醛基胞嘧啶(5fC)单碱基分辨率、全基因组水平测序。

  5-甲基胞嘧啶修饰(5mC)是真核细胞基因组中最为重要的表观遗传修饰之一。5mC可以在TET家族酶的作用下,逐步氧化生成5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC);后两者也可以被TDG糖基化酶所识别并切除。对于上述几种新型DNA修饰的功能研究是目前核酸表观遗传学的一个研究热点。而其中一个主要的难题,就是如何实现5fC等核酸修饰在基因组中的精准定位。

关键词:论文